明朝崇禎15年，全國內憂外患，大將孫傳庭（戴立忍 飾）臨危受命帶著妻子馮氏（馮波 飾）來到潼關抵抗李自成的*隊。與此同時遊醫吳又可（馮遠征 飾）懷著濟世救人之心來到潼關拜訪師傅——*局提領趙川（錢學格 飾）。大敵當前，孫傳庭*中士兵染上怪病，同時還要面對崇禎皇帝（餘少群 飾）的催促出兵和潼關豪紳顧清遠（馬精武 飾）等人的自私斂財。趙川因施救不力以身殉職，吳又可在危難之時挺身而出，靠著不同尋常的治療方法與孫傳庭惺惺相惜。最後瘟疫終於被控制住，但是國家的病症能否被戰爭治好吳又可和孫傳庭都無法預料。
本片主題曲由BossaNova女王小野麗莎演唱，這是小野麗莎首次用中文演繹自己的歌曲作品。
我朝積弊已久，非一味猛*可以痊癒。
你覺得大明朝，氣數已盡了嗎？
天下糜爛，流賊四起。百姓從賊，全因飢寒所致。百姓飢寒，全因無地可耕所致。得人心者得天下，你以為人心是什麼？人心，就是糧食，就是源源不絕的後備兵員，這就是他李自成輸得起十回八回，而我孫傳庭一回都輸不起！
孫傳庭所率的，可是我大明朝唯一的精銳了！
我覺得此症絕非傷寒，更像是人吸入了邪氣。
這些是給我孫傳庭的，這些是給大明朝的，如果大明朝亡了，你們給我孫傳庭還有什麼用！
我能信你，可又有誰能信我呢？
開封重鎮苦守三月，每天死的都是朕的子民！
難道天要絕我？
這個*營外的村莊人都快四絕了，整個兵營沒有一個人能活，你我都得死！
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