五種主要的轉基因作物為:轉基因大豆,轉基因棉花,轉基因稻穀,轉基因油菜籽和轉基因玉米。也有相對較少量的轉基因木瓜、南瓜。
科學家們已繪成一株轉基因木瓜的基因草圖,這對於該水果的培育和充分了解果樹基因組都有重要的意義。