念珠菌屬屬於真菌界半知菌亞門、芽孢菌綱、隱球菌酵母目、隱球菌酵母科。
歸有五個界:動物界、植物界、真菌界、茸鞭生物界——包括單細胞植物,如硅藻——和原生動物界,或單細胞生物體。
五種生物分類之一;無核原生物界、原生生物界、植物界、真菌界、動物界。